成立於2000年
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慧 眾 生 物 科 技 有 限 公 司
3
EasyPure
質粒DNA微量製備試劑盒
故障排除
樣品名稱:
1-4 ml細菌培養物
產量:
高達30 ug質粒/粘粒DNA
格式:
旋轉柱
操作時間:20 min洗脫體積:50-100 ul儲存條件:
在室溫(15- 25 ℃)下。
問題
可能的原因/解決方案
低產
細菌細胞未完全裂解
* 使用了太多的細菌細胞。如果使用超過10 A單位的細菌培養物,則將其分離到多個試管中。* 加入PD 3緩衝液後,通過倒置使沉澱物破碎,以確保更高的產率。
DNA洗脫步驟不正確
* 確保加入洗脫緩衝液並吸收到旋轉柱基質的中心
DNA洗脫不完全
如果質粒DNA大於10 kb,則在洗脫步驟中使用預熱洗脫緩衝液(60-70 ℃)以提高洗脫效率。
清洗緩衝液不正確
檢查以確保在使用前已將乙醇添加到清洗器中。
洗脫的DNA
表現不佳
下游
應用
殘留乙醇污染
* 在洗滌步驟後,乾燥旋轉柱,同時以最高速度額外離心5分鐘或在60 ℃下孵育5分鐘。
RNA污染
* 在使用PD1緩衝液之前,檢查是否添加了RNase A。如果添加RNA酶A的PD1緩衝液過期,則添加額外的RNA酶A。
* 使用太多細菌細胞,減少樣品體積。
基因組DNA污染
* 請勿使用過度生長的細菌培養物。
* 在PD2和PD3緩衝液添加期間,輕輕混合以防止基因組DNA剪切。
核酸酶污染
如果宿主細胞具有高核酸酶活性(例如,endA+菌株),進行該可選清洗步驟以去除殘留的核酸酶。
以6000xg(8,000rpm)的轉速旋轉30秒。
從標準清洗步驟繼續。
僅供研究使用。
不用於診斷或治療程式
* 首次使用前,向清洗緩衝液中加入100 ml乙醇(96-100%)。** 在首次使用前,向洗滌緩衝液中加入160 ml乙醇(96-100%)。
將提供的RNA酶A加入PD 1緩衝液中並在4 ℃下儲存。
如果在PD 2緩衝液中形成沉澱,則在37 ℃水浴中加熱緩衝液以溶解。PD 3緩衝液含有鹽酸胍,這是有害的和刺激性的。在操作過程中,始終穿戴實驗服、一次性手套和護目鏡。
目錄號PM100 100 mini preps / kit PD 1緩衝液:25 ml PD 2緩衝液:25 ml PD 3緩衝液:40 ml W1緩衝液:50 ml洗滌緩衝液(濃縮):25 ml * 洗脫緩衝液:6 ml
RNase A(50 mg/ml):50 μ l 2 ml收集管:100 pcs PD柱:100 pcs
目錄號PM 300 300 mini preps / kit PD 1緩衝液:65 ml PD 2緩衝液:75 ml PD 3緩衝液:100 ml W1緩衝液:130 ml洗滌緩衝液(濃縮):40 ml ** 洗脫緩衝液:30 ml
RNase A(50 mg/ml):130 μ l 2 ml收集管:300 pcs PD柱:300 pcs
高拷貝數方案
收穫1.將1.5 ml細菌培養物轉移至微量離心管(未提供)中。
2.在微量離心機中以全速(13,000 rpm)離心1 min,棄去上清液。(If如果使用的細菌培養物超過1.5 ml,則重複收穫步驟。對於超過4 ml,使用多個色譜柱。)重懸3.加入200 μ l PD 1緩衝液(加入RNA酶A),通過渦旋或移液使細胞沉澱重懸。裂解4.加入200 ul PD 2緩衝液,並通過倒置試管10次輕輕混合。不要渦旋,避免剪切基因組DNA。
5.使混合物在室溫下靜置2分鐘,直至裂解物澄清。中和6.加入300 μ l PD 3緩衝液,並立即將試管倒置10次混合。請勿渦旋。
7.全速攪拌2分鐘。dna結合
8.將PD色譜柱置於2 ml收集管中。
9.將步驟7中的澄清裂解物(上清液)應用於PD色譜柱。
10.全速前進30秒。
11.棄去流通液,將PD色譜柱放回2 ml收集管中。洗
12.在PD柱中加入400 ul W1緩衝液。
13.全速前進30秒。
14.棄去流出液,並將PD柱放回2ml收集管中。
15.向PD柱中加入600 μ l洗滌緩衝液(加入乙醇)。
16.全速前進30秒。
17.棄去流出液,並將PD柱放回2 ml收集管中。
18.再次全速沖洗3 min,使色譜柱基質乾燥。
低拷貝數方案根據組分說明將乙醇和RNA酶A加入緩衝液中。
當從LB培養基中過夜細菌培養物製備低拷貝數質粒時,典型的產量為約0.5 - 1.0 μ g/1 ml培養物。
收穫1.通過離心收穫ep至10 ml過夜培養物。重懸2.加入400 μ l PD 1緩衝液(加入RNA酶A),通過渦旋或移液使細胞沉澱重懸。裂解3.加入400 μ l PD 2緩衝液,倒置試管10次,輕輕混合。不要渦旋,避免剪切基因組DNA。
4.使混合物在室溫下靜置2分鐘,直至裂解物澄清。第五章.加入600 μ l PD 3緩衝液,並通過倒置試管10次立即混合。請勿渦旋。
6.全速攪拌2分鐘。7.將PD色譜柱置於2ml收集管中。
8.將750 ul來自步驟6的澄清裂解物(上清液)上樣至PD柱。
9.以10,000xg(13,000rpm)的轉速旋轉30秒。棄去流出液,並將PD柱放回2ml收集管中。
10.將剩餘的澄清裂解物上樣至相同的PD色譜柱。
11.以10,000xg(13,000rpm)的轉速旋轉30秒。
12.棄去流出液,並將PD柱放回2ml收集管中。
Wash
13.在PD柱中加入400 ul W1緩衝液。
14.以10,000xg(13,000rpm)的轉速旋轉30秒。
15.棄去流出液,並將PD柱放回2ml收集管中。
16.向PD柱中加入600 μ l洗滌緩衝液(加入乙醇)。
17.以10,000 xg(13,000 rpm)轉速旋轉30秒。
18.棄去流出液,並將PD柱放回2 ml收集管中。
19.再次全速攪拌2 min,使色譜柱基質乾燥。20.第二十三章將乾燥的PD柱轉移到乾淨的1.5 ml微量離心管(未提供)中。
21.將50 ul洗脫緩衝液或ddH 2 O(pH 8.0-8.5)直接添加到膜中心。如果質粒DNA大於10 kb,則在洗脫步驟中使用預熱洗脫緩衝液(60-70 ℃)以提高洗脫效率。
21.靜置2分鐘,直至液體被基質吸收。
22.以全速電泳2分鐘以純化DNA。
19.第十九章將乾燥的PD色譜柱轉移至乾淨的1.5 ml微量離心管(未提供)中。
20.將50 μ l洗脫緩衝液或ddH 2 O(pH 8.0-8.5)直接加入膜中心。避免殘留緩衝液粘附在色譜柱壁上。
21.靜置2分鐘,直至液體被吸收。22.以全速電泳2分鐘以純化DNA。